Le budget d'Orphanet s'élevait à 1,2 millions d'Euros en 2009, provenant de 14 contrats différents à Paris.

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L'Inserm finance l'activité centrale d'Orphanet. Le DSI de l'Inserm héberge les serveurs d'Orphanet.Inserm Transfert est en charge de la valorisation d'Orphanet. |
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La Direction Générale de la Santé finance l'activité centrale d'Orphanet.
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La Commission Européenne finance l’encyclopédie et la collecte de données dans les pays européens (depuis 2000, contrats n° S12.305098; S12.324970; SPC.2002269-2003220 de la DG Santé Publique et des Consommateurs et depuis 2004, contrats n° LSSM-CT-2004-503246; FP6-512148; LSHB-CT-2006-08933 de la DG Recherche). |
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L'Agence de la biomédecine finance le suivi de la liste des laboratoires, la création des outils de collecte et de gestion des rapports annuels d'activité et leur suivi, ainsi que la compilation des données collectées en France. |
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La Caisse nationale de solidarité pour l'autonomie finance l'indexation des maladies rares avec les termes de la Classification internationale du fonctionnement, du handicap et de la santé (CIF), l'enrichissement de l’Encyclopédie Orphanet grand public avec des informations sur les conséquences fonctionnelles des maladies rares, ainsi que la production de fiches d’information sur les handicaps rares non nécessairement liés à des maladies rares. |
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L'Institut national du Cancer (INCa) finance l'enrichissement de l'encyclopédie Orphanet sur les cancers rares. |
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L’Association Française contre les Myopathies finance OrphaNews France et OrphaNews Europe ainsi que la collecte de données sur les essais cliniques. |
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Les Entreprises du Médicament (LEEM) finance la collecte de données sur les médicaments orphelins et les essais cliniques. |
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La Fondation Groupama pour la santé finance le service d’aide aux associations pour la création et le développement de leur site web en France. |
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LFB Biomédicaments contribue au financement du développement et de la mise à jour de fiches d’urgences et de l’encyclopédie francophone pour le grand public. |
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GlaxoSmithKline (GSK) finance l’expansion de l’annotation des maladies rares et la transformation de l’inventaire des maladies en ontologie. |
Orphanet France a établi plusieurs conventions de partenariat au niveau national :
Par ailleurs, Orphanet est financé par d'autres contrats européens (voir le Rapport d'Activité).
Mise à jour le 6 janvier 2011